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上海师范大学研究生院（官网：yjsc.shnu.edu.cn）主要负责研究生教育管理工作，上海师范大学研究生院下设综合办公室、招生与信息管理办公室、培养办公室、学位办公室、评建办公室、思政办公室、奖助办公室等部门，目前在校硕士、博士研究生已逾8600人。

上海师范大学1981年被国务院学位委员会确定为首批硕士学位授予单位，1986年被批准为博士学位授予单位，上海师范大学研究生院拥有9个一级学科博士点、32个一级学科硕士点、16个专业学位硕士点，覆盖哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、管理学、艺术学等10个学科门类。